学校高度重视科研工作，围绕人才培养和产业发展需求建成“科技服务中心”，涉及中药天然药、中医病证和病理学等8个研究领域，按照上游开展中药材种植技术推广和质量把控、中游开展中药材深加工和产品开发、下游开展精准医学和医养健康服务“三段式”发展格局开展科学技术研究；与附属中医院共同搭建遵义中医药研究院，可开展中医健康医养、中药材种植加工、疾病防治物质基础、药食妆食同源产品研发、院内制剂开发等方面的研究；建成“黔药资源信息库”，应用良好；获得“贵州省中医优势专科建设工程”项目试点单位；建有1个省级、3个市级科普教育基地，常年对校内外开放。“十四五”期间，新建成1支省级、2支市级科技创新人才团队，新增市级科技特派员7名，获省高层次创新型人才荣誉9项、省级科研成果奖5项。

学校2021年获批省职业院校服务产业链中“健康医药”牵头学校和“中药材”、“健康医养”参建学校，作为主要参与单位编制《遵义市中医药产业发展规划（2024-2030年）》，对接11家省内外企业深度开展科技合作，科研成果得到转移转化，4项校企合作“妆食同源”产品通过国产普通化妆品备案。2023年获批国家自然科学基金依托单位，2024年获批全国中医药科技成果直通车承办单位。

2019年以来，学校主持市厅级及以上纵向科研项目共173项，其中，主持完成国家自然科学基金项目2项，获批省科技厅项目9项、省教育厅和省社科联项目共35项、市级科技计划/科技合作项目共117项，获批科研项目经费总计913万元，其中技术合同登记总金额累计431万元；以第一作者或通讯作者发表学术论文584篇，其中SCI期刊论文42篇、北大核心期刊论文70篇；授权专利88项，其中发明专利13项、实用新型专利64项、软件著作授权8项，制定企业标准3项，传统中药制剂备案1项。（数据截至2024年12月）